进入大树背后的路径需要跨越现代与古代两个时空维度。玩家需先在工厂区域获得化石蛋，随后在操作台用开关将其砸碎得到种子。此过程中，修复工厂电路是重要前置条件，需使用胶带连接断裂的线路，这一操作直接影响工厂设备的启动。玩家需在灯塔三层获取异形钥匙，并在神庙密室中激活时间机器，通过涂抹笔记本撕页的铅笔痕迹破解时空密码。
携带种子返回过去时空，将种子交给悬崖边的少年。这一行为将触发时间悖论，当玩家再次回到现代时，原本无法攀爬的悬崖已生长出巨型古树。种植过程需先完成冷冻舱机关，通过拖动八根条状物使颜色匹配，该谜题解法直接影响时空连贯性。古树的生成验证了游戏的核心设定：过去的行为会永久改变现代的地貌结构。
攀爬古树后，玩家将进入外星飞船区域。飞船大门的密码线索隐藏在工厂左侧屋子的壁画上，需将现代收集的蓝色石块与壁画符号对应。进入飞船内部后，需在驾驶室完成终极电路谜题：通过旋转九宫格方块调整反射板角度，使三条能量线同时连通。成功启动飞船后，大树背后的隐藏通道才会显现，此处通往游戏的真结局，揭示岛屿时间循环的本质。
